No aterro sanitário (local composto por uma ou mais células devidamente impermeabilizadas, o que impede infiltrações no solo e nos lençóis freáticos) os resíduos indiferenciados são diariamente depositados e cobertos com terra, para evitar a exposição ao ar, odores desagradáveis, propagação de insetos, ou outros vetores de doenças.

Num sistema de gestão integrada, a deposição em Aterro é a última opção utilizada, sendo que resulta de um plano de proteção ambiental que inclui a monitorização da drenagem adequada de lixiviados e de biogás (gases provenientes da biodegradação da massa de resíduos), o qual é encaminhado para valorização energética ou queima, o controlo das águas subterrâneas/superficiais e das alterações topográficas.

Quando atinge o limite da sua capacidade, o aterro sanitário é alvo de um processo rigoroso de encerramento e arranjo paisagístico adequado, podendo ser, posteriormente, um espaço verde ou um parque de lazer para usufruto da população, cumprindo as boas condições de segurança e ambientais.

O processo de Deposição em Aterro Sanitário, integra ainda, as seguintes instalações:

- Estação de Tratamento de Águas Lixiviantes

As águas resultantes da decomposição dos resíduos depositados em aterro, após captadas são tratadas na Estação de Tratamento de Águas Lixiviantes, através de um sistema de “osmose inversa”, são aproveitadas para a lavagem de viaturas e pavimentos da Algar.

- Estação de Transferência

A Estação de Transferência é uma instalação de receção de resíduos provenientes de localizações mais distantes dos aterros sanitários, que tem como objetivo melhorar a eficiência do transporte dos resíduos gerados nos municípios que se encontrem longe da instalação de tratamento, cumprindo assim o objetivo de otimizar circuitos e articular com as Autarquias uma otimização de custos, de forma ágil.

A ALGAR tem 8 Estações de Transferência que se encontram sediadas nos Municípios de Albufeira, Alcoutim, Aljezur, Castro Marim, Lagos, Loulé, Tavira e Vila do Bispo, onde se recebem os resíduos indiferenciados que são entregues pelos Municipios. Estes resíduos são compactados e transportados para os aterros sanitários.