As Unidades de Triagem são instalações com equipamentos específicos que asseguram a separação mecânica e manual de todos os materiais recebidos e que foram recolhidos seletivamente junto da população. A separação dos vários tipos de materiais permite encaminhar estes resíduos para a indústria da reciclagem com os requisitos de qualidade necessários. Desta forma, os materiais recicláveis separados pela população e colocados nos ecopontos (ou recolhidos por outro sistema) podem ser transformados no futuro em novos produtos.

A Algar dispõe de 2 Unidades de Triagem de embalagens com diferentes dimensões e capacidades, que asseguram esta tarefa minuciosa com qualidade e rigor, uma localizada no Aterro Sanitário do Barlavento, em Portimão e outra na Estação de Transferência de Faro/Loulé/Olhão, concelho de Loulé, cobrindo desta forma toda a região do Algarve. Em 2023 foram tratadas 40 mil toneladas de papel, vidro, plástico e metal, devidamente encaminhadas para reciclagem, poupando recursos ao país e ao planeta.